وجه رئيس جمهورية جنوب السودان سلفاكير ميارديت إنتقادات لتقارير الأممية بشأن أوضاع حقوق الإنسان، مبيناً أن منظمات الحقوقية والنشطاء، يركزون على جوانب سلبية لا تستند على الحقائق في بلاده.
يصف التقارير الأممية الأوضاع الإنسانية في جنوب السودان أنها (ألافظع) في العالم، بجانب اتهامات للمسؤولين في الحكومة والمعارضة بإرتكاب جرائم الإغتصاب للنساء والقتل كمكافاة لجنودهم.
وقال كير في خطابه الخميس لدى حفل تخريج دفعة من الشرطة، أن محققين الأمم المتحدة الخاصة بحقوق الإنسان يصدرون تقارير لا تستند الى أدلى واقعية بوجود إبادة جماعية وانتهاكات إنسانية، وذاد "هؤلاء عندما يصلون جوبا، يقومون بتحقيق عن حقوق الإنسان وبعد خروجهم من جوبا يصدرون تقارير تتحدث عن الإبادة الجماعية، هل هناك أدلة؟"
في عام 2016 أصدر الأمم المتحدة تقريراً قال فيه أن حجم طابع الاعتداءات الجنسية ارتكبتها القوات الحكومية ومليشيات موالية لها، وتشمل عمليات الذبح للمدنيين والتدمير للممتلكات المواطنين في مناطق الذي يشهد القتال.
وتطالب منظمة هيومن رايتس ووتش، بإجراء التحقيقات مع جنرالات في الحكومة والمعارضة المسلحة لارتكابهم جرائم قد تصل إلى جرائم الحرب منذ اندلع القتال عام 2013 بين الحكومة والمعارضة المسلحة.
نصت إتفاقية تسوية النزاع الموقع بين الحكومة والمعارضة المسلحة عام 2015 على تكوين محكمة هجين لمحاكمة المتورطين في جرائم الحرب، يتم تشكيل المحكمة من أجانب وجنوب السودانين للنظر في تلك القضايا.